Facteurs influents
Substrats fermentescibles : Composés alimentaires non digérés par les enzymes humains mais utilisables par les bactéries.
- Les fibres alimentaires servent de substrat pour la fermentation bactérienne
- Les polyphénols ont un effet prébiotique sur certaines bactéries
- Les graisses saturées favorisent certaines bactéries pro-inflammatoires
- Les protéines animales influencent la production de composés toxiques
Les fibres solubles et insolubles nourrissent les bactéries bénéfiques
Les bactéries fermentent les fibres en acides gras à chaîne courte
Les bactéries fermentant les fibres prolifèrent, les autres diminuent
Les AGCC produits influencent la santé intestinale et systémique
Un régime alimentaire durable modifie la composition microbienne
L'alimentation influence profondément le microbiote en fournissant des substrats fermentescibles. Une alimentation riche en fibres favorise les bactéries bénéfiques et la production d'acides gras à chaîne courte, tandis qu'une alimentation riche en graisses et en sucres favorise les bactéries pro-inflammatoires.
• Fibres : augmentation des Bacteroidetes, production d'AGCC
• Régime méditerranéen : effet positif sur la diversité
• Diète occidentale : réduction de la diversité
• Aliments fermentés : apport de bactéries bénéfiques
• Polyphénols : effet prébiotique
Antibiotiques : Substances antimicrobiennes qui tuent ou inhibent la croissance des bactéries.
Les antibiotiques affectent les bactéries bénéfiques et pathogènes sans distinction
Nombreuses espèces bactériennes sont éliminées simultanément
Modifications des proportions relatives des espèces restantes
Certaines fonctions métaboliques sont compromises
Moins de protection contre les pathogènes pendant le traitement
Les antibiotiques perturbent gravement le microbiote en éliminant de nombreuses espèces bactériennes, réduisant la diversité, modifiant la structure du microbiote et compromettant certaines fonctions métaboliques. Le microbiote peut ne jamais retrouver exactement son état initial.
• Réduction de la diversité bactérienne
• Diminution des Firmicutes
• Augmentation des Proteobacteria
• Perte de fonctions métaboliques
• Risque de dysbiose persistante
Stress : Réaction physiologique et psychologique à des stimuli perçus comme menaçants ou exigeants.
Stress → Hypothalamus → Hypophyse → Corticosurrénale → Cortisol
Adrénaline et noradrénaline affectent directement la flore bactérienne
Stress → Changements de motilité intestinale → Modifications environnementales
Diminution des Lactobacillus et Bifidobacterium, augmentation des pathobiontes
Changements microbiaux influencent la réponse au stress
Le stress affecte le microbiote par l'activation de l'axe hypothalamo-hypophyso-surrénalien, la libération de catécholamines, la modification du transit intestinal et des changements dans la composition microbienne, créant une boucle de rétroaction entre le stress et la dysbiose.
• Diminution de la diversité microbienne
• Réduction des bactéries bénéfiques
• Augmentation des bactéries pro-inflammatoires
• Altération de la barrière intestinale
• Changement de l'axe intestin-cerveau
Activité physique : Exercice régulier qui influence les fonctions physiologiques et métaboliques.
L'activité physique améliore la motilité intestinale
Meilleure irrigation sanguine de la muqueuse intestinale
L'exercice influence la production de métabolites musculaires
Modification des hormones qui influencent le microbiote
Augmentation de la diversité microbienne et des bactéries bénéfiques
L'activité physique influence positivement le microbiote en améliorant le transit intestinal, la circulation sanguine, en modifiant les hormones et en augmentant la diversité microbienne. L'exercice régulier favorise les bactéries bénéfiques et améliore la santé intestinale.
• Augmentation de la diversité microbienne
• Favorise les bactéries productrices d'AGCC
• Amélioration du transit intestinal
• Renforcement de la barrière intestinale
• Effets anti-inflammatoires
Cycle veille-sommeil : Rythme circadien influençant de nombreuses fonctions physiologiques.
Le microbiote a son propre rythme circadien synchronisé avec l'hôte
Un bon sommeil soutient les fonctions métaboliques du microbiote
Insomnie ou troubles du sommeil affectent la composition microbienne
Manque de sommeil peut entraîner une inflammation qui affecte le microbiote
Le microbiote influence à son tour la qualité du sommeil
Le sommeil influence le microbiote par l'intermédiaire du rythme circadien. Un bon sommeil soutient la diversité microbienne et les fonctions métaboliques, tandis que les troubles du sommeil peuvent entraîner des modifications de la composition microbienne et une inflammation.
• Synchronisation des rythmes circadiens
• Maintenance de la diversité microbienne
• Régulation de l'inflammation
• Équilibre des fonctions métaboliques
• Boucle de rétroaction avec l'axe sommeil-microbiote
Colonisation initiale : Processus par lequel les premiers microorganismes colonisent le nouveau-né.
Le bébé est exposé au microbiote vaginal et fécal de la mère
Le nouveau-né acquiert principalement des Lactobacillus et des bactéries anaérobies
Le bébé n'est pas exposé au microbiote vaginal, mais à la flore cutanée
Enfants nés par césarienne ont plus de Staphylococcus, moins de Bacteroides
Possibles différences dans le développement immunitaire et la santé
Le mode d'accouchement influence la colonisation initiale du microbiote : l'accouchement vaginal expose le nouveau-né au microbiote vaginal de la mère, tandis que la césarienne expose principalement à la flore cutanée, entraînant des différences dans la composition microbienne initiale.
• Accouchement vaginal : exposition au microbiote vaginal
• Césarienne : exposition à la flore cutanée
• Différences dans la diversité initiale
• Potentiellement lié à des risques d'allergies
• Effets potentiels sur le développement immunitaire
Infection : Invasion de l'organisme par des microorganismes pathogènes.
Les pathogènes perturbent la barrière compétitive du microbiote
L'infection déclenche une réponse inflammatoire qui affecte le microbiote
Modification du pH, de l'oxygénation, de la disponibilité des nutriments
Certaines bactéries prolifèrent dans les nouvelles conditions
Après guérison, le microbiote peut ou non retrouver son état initial
Les infections affectent le microbiote en perturbant la barrière compétitive, en déclenchant une réponse inflammatoire, en modifiant les conditions environnementales intestinales et en provoquant des changements sélectifs dans la composition microbienne, avec des effets variables selon la gravité et la durée de l'infection.
• Perturbation de la barrière compétitive
• Réponse inflammatoire
• Changement des conditions environnementales
• Modifications sélectives de la flore
• Risque de dysbiose persistante
Facteurs environnementaux : Éléments extérieurs influençant la composition et la diversité du microbiote.
Moins d'exposition aux microorganismes naturels
Substances chimiques qui peuvent affecter la flore microbienne
Exposition à plus de microorganismes diversifiés
Différents niveaux d'exposition microbienne
Activités extérieures, contact avec la nature
L'environnement influence le microbiote par le niveau d'hygiène, la pollution, le contact avec les animaux, les différences entre milieux rural et urbain, et le mode de vie. Un environnement plus naturel favorise une diversité microbienne plus élevée.
• Hygiène excessive : réduction de la diversité
• Pollution : effets toxiques potentiels
• Contact avec les animaux : augmentation de la diversité
• Milieu rural : plus grande diversité
• Exposition naturelle : renforcement de la flore
Médicaments non antibiotiques : Substances pharmaceutiques affectant indirectement le microbiote.
Les AINS peuvent affecter la barrière intestinale et la flore
Modifient le pH gastrique, affectant la flore intestinale
Metformine influence la composition microbienne
Affectent l'axe intestin-cerveau et la flore
Les effets s'additionnent avec l'utilisation prolongée
De nombreux médicaments non antibiotiques affectent le microbiote : les anti-inflammatoires, les inhibiteurs de la pompe à protons, les antidiabétiques et les antidépresseurs peuvent tous modifier la composition microbienne par différents mécanismes, avec des effets variables selon la durée et la dose de traitement.
• AINS : altération de la barrière intestinale
• IPP : modification du pH gastrique
• Metformine : changement de la flore
• Antidépresseurs : effet sur l'axe intestin-cerveau
• Effets cumulatifs : dépendent de la durée
Développement du microbiote : Processus évolutif de la composition microbienne au cours de la vie.
Colonisation initiale, faible diversité, dominance de Bifidobacterium
Diversification progressive, transition vers un microbiote adulte
Stabilisation progressive, approche du profil adulte
Microbiote relativement stable, diversité maximale
Diminution de la diversité, changements fonctionnels
L'âge influence le microbiote de manière dynamique : il est faiblement diversifié chez le nouveau-né, se diversifie progressivement jusqu'à l'âge adulte où il atteint sa diversité maximale, puis tend à se simplifier avec l'âge avancé, avec des changements fonctionnels importants.
• Nouveau-né : faible diversité, dominance Bifidobacterium
• Nourrisson : transition vers profil adulte
• Enfant : stabilisation progressive
• Adulte : diversité maximale
• Vieillesse : diminution de la diversité
